Berdasarkan surat keputusan Bupati Bantul, mulai 1 Februari 2019 terjadi perubahan pimpinan di SMP 3 Imogiri. Pejabat lama ibu Wiwik Sulistiyorini S.Pd M.M digantikan oleh pejabat baru bapak Rubingat S.Pd. Lepas sambut kepala sekolah SMP 3 Imogiri dilaksanakan pada hari Selasa, 29 Januari 2019. Bapak Rubingat S.Pd sebelumnya menjabat kepala sekolah di SMP 3 Kasihan dan ibu Wiwik Sulistiyorini S.Pd M.M selanjutnya akan menjabat sebagai kepala sekolah di SMP 3 Kasihan. Hadir dalam acara tersebut Plh Kepala Dinas Dikpora Bantul, Kepala Bidang SMP Dikpora Bantul, Tripika Kecamatan Imogiri, MKKS Pokja 12 Imogiri, Lurah Desa Selopamioro, Komite Sekolah SMP 3 Imogiri, Guru/karyawan SMP 3 Kasihan dan Guru/karyawan SMP 3 Imogiri.